工程結算審計是對施工單位在工程竣工或年度終了時，與建設單位所辦理的工程價款結算的審計。其主要內容：(1)中間結算(含跨年)檢查工程形象進度的工程量，施工產值和預算成本是否正確、真實、本期應結工程價款凈值是否與本期實際完成的施工產值或結算價值，扣除預收工程款、抵扣備料款、甲方材料款以及其他應扣款后的余額相符；(2)竣工結算，應審查竣工質量驗收、竣工決算的合規性，未完部分尾工預提費用的合理性以及雙方經濟往來是否清楚，有無違反結算紀律行為。